不同植物對濕地中污染物的吸收能力不同，在進行植物配置時，首先應對水體中的污染源進行檢測，然后根據檢測結果進行針對性的植物配置。在選擇植物時，宜優先選用當地或本地區天然濕地中存在的植物，即鄉土濕地植物，因為鄉土濕地植物具有良好的生態適應能力和生態營建功能，將會減少后期管理上的許多麻煩。此外，還要考慮濕地植物的年生長周期，最好是冬季半枯萎或常綠植物，這樣可以兼顧人工濕地的冬季景觀，尤其是在居住區等對景觀要求比較高的濕地更為重要。最后，還要注意所選的植物不能對當地的生態環境構成隱患或威脅，要保證生態安全性。
