南方紅豆杉集藥用、材用、觀賞于一體，具有較高的開發利用價值。因其種皮透性差，休眠期長，種子繁殖難度大。但只要掌握南方紅豆杉的生物學特性，嚴格按技術規程操作，育苗一定會取得成功，其具體操作如下：
一、圃地選擇和施肥 圃地選擇以土層深厚、結構疏松、富含有機質、排水良好、不受西曬的稻田為宜(必須是當年收割的稻田土)。整地在收割中晚稻后，土壤干燥后深翻一次，碎土一次，爾后分廂做床。寬床1.5米(凈床面寬1.2米，步道寬0.3米)；床高20厘米，苗床長度視苗圃地而定。在整地做床的同時,每畝施入腐熟的豬牛糞8000斤左右，速溶優質復合肥200斤，并拌入呋喃丹6至8斤防治地下害蟲。在將肥料翻拌入土層并將整平廂面后，在廂面上填黃心土，厚5厘米。
二、適時播種 種子通過一年的貯藏，有部分裂口。這時篩出洗凈，用0.05％的高錳酸鉀液浸種消毒10分鐘，再用清水沖洗干凈，晾干后即可播種。
播種分撒播和條播兩種：撒播是將種子均勻地撒在填好黃心土的苗床上，用黃心土覆蓋種子，以不見種子為度，再用苔蘚將苗床全部覆蓋。條播則選取15厘米寬的木板，在填好黃心土的苗床上壓播種溝，深2厘米，播種溝之間的距離15至20厘米。將種子均勻播種于溝內，并用黃心土蓋種，厚度1厘米，再用苔蘚覆蓋播種溝。
應注意的是：一是嚴格控制播種量，每畝用種為15公斤，否則會嚴重影響二年生苗木合格出苗率；二是播種后，撒播必須用苔蘚將苗床全部覆蓋，條播只要將苔蘚覆蓋播種溝。幼苗出土后，也不要將苔蘚揭去，長期保持在苗床上。苔蘚護苗優點為：保護苗床不受雨水濺擊和陽光直射，使苗木不受陽光灼傷及避免因莖、葉沾泥形成泥棒而窒息死亡，并且經常保持土壤疏松、濕潤，減少中耕除草用工。但覆蓋的苔蘚要薄，不能太厚，如遇久旱不雨，可用細黃土壓住苔蘚，或用噴霧器噴水保持苗床濕潤。
三、田間管理
1. 幼苗遮陰 幼苗出土前，必須將陰棚架好，棚高1.7米。三伏天，苗床要用遮陰。
2．病蟲害防治 幼苗出土后正值雨季，因雨水多、空氣濕度大，幼苗易感染病菌而發生根腐和猝倒病，造成育苗全部失敗。故重在于“防”，即在幼苗出土隔7天噴800倍托布津或半量式：波爾多液（0.5硫酸銅、0.5斤石灰、100斤水）噴霧，向幼苗莖干和葉背、葉面噴施。
3. 中耕除草、施肥 在苗木生長期間，注意除草松土，改善土壤通氣條件。除草原則為：除小，除早。苗木生長前期追肥，以氮、磷肥為主，用10％的稀入糞尿加0.4斤尿素配制，每隔半月施一次。9月中旬停施，并將遮陰網拆走，棚架留下來年再用。
4．幼苗移栽 如因播種不勻，造成苗木過密過稀，在5月底至6月中旬，須進行苗木移植，間密補稀。移栽方法為：選擇陰雨天或雨后進行移栽，覆蓋好苔蘚后，用清水淋蔸，移栽。
四、二年生苗木管理 在苗木移栽前，將陰棚架好，并及時清除步道和四周雜草。對瘦弱苗加大追肥，促進生長。
通過精細管理，一年生苗高12至25厘米，二年生苗高為30至35厘米，地徑粗O.5厘米，畝產苗木達6萬株。
